在一场车祸中,永井圭(佐藤健 饰)意外发现自己竟然是一名“亚人”。亚人,拥有着和人类一样的外貌,却有着惊人的自愈能力和不死之身,为了获得亚人神秘的力量,政府逮捕并监禁了现今已经发现的亚人们,包括永井圭,在他们身上进行残忍的活体实验,然而对外,政府却声称这一行为是在保护亚人。 同样身为亚人的佐藤(绫野刚 饰)救出了永井圭,希望后者能够加入自己的阵营。佐藤依靠着进行恐怖活动来威胁政府,提出建立亚人自治区的诉求。永井圭知道佐藤生性贪婪邪恶,不愿意就范,因此亦被佐藤视为敌人。身处漩涡的中心,永井圭知道,这并不单单只是佐藤和自己的战争,而是人类和亚人之间的博弈。
由于两年前揭发同僚贪污,台北警官黄火土(梁家辉)被上级报复调入冷门的外事组工作,利益也曾连带受损的新同事对他怒言相向,加上妻子清芳(刘若英)受不了他长期不回家要求离婚,黄火土感觉他的世界正在逐渐四分五裂。 就在此时,三宗受害者的身份并无关联的震惊了台湾社会的离奇命案发生,法医(杨贵媚)验尸发现他们都是因中一种神秘的黑霉菌产生幻觉而死,因为缺乏此方面的人才,当局从美国请来此种案例的侦办专家凯文莱特(David Morse)协助破案,黄火土重被任用。随着一桩令所有人都目瞪口呆的事实的被发现,一场围绕政治利益与民众利益的斗争也在黄火土和办案伙伴李丰博(戴立忍)及整个警察队伍之间展开。
艾米利(张曼玉 饰)曾经是一个音乐节目主持人,她的丈夫行为先锋不羁,是一个过气的摇滚歌星。他们都嗜毒,丈夫还因为吸毒过量而死。而艾米利则被搜出毒品而被判6个月监禁。因为夫妻一直过着不正常的生活,所以儿子被爷爷奶奶领走抚养,想给他一个清洁的成长环境。 艾米利出狱后,她强烈的想要回儿子的抚养权,然而长辈却没有办法相信艾米利能尽好母亲的责任。为了能和儿子重聚,艾米利找了一份餐馆的工作,努力戒掉毒瘾,让自己成为一个清洁的母亲。正巧此时奶奶患病,爷爷分身乏术,无法照料孙子,这样一来,事情真的可以遂愿么?